各中医院校建校之初，均名中医学院，从90年代以来，一批中医学院更名为中医药大学。“十五”期间（2001年到2005年），国家中医药管理局协助教育部开展了中医药院校更名为大学的工作，促成了5所中医学院更名为中医药大学，6所中医药学校升格为中医药高等专科（高职）学校。截止2019年1月，中国有23所中医学院更名为中医药大学，还称中医学院的就只剩下河北中医学院一个了。
| 学校名称 | 学校标识码 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|
| 北京中医药大学 | 4111010026 | 教育部 | 北京市 | 本科 | |
| 天津中医药大学 | 4112010063 | 天津市 | 天津市 | 本科 | |
| 北京中医药大学东方学院 | 4113013899 | 河北省教育厅 | 廊坊市 | 本科 | 民办 |
| 河北中医学院 | 4113014432 | 河北省 | 石家庄市 | 本科 | |
| 山西中医药大学 | 4114010809 | 山西省 | 太原市 | 本科 | |
| 辽宁中医药大学 | 4121010162 | 辽宁省 | 沈阳市 | 本科 | |
| 辽宁中医药大学杏林学院 | 4121013609 | 辽宁省教育厅 | 沈阳市 | 本科 | 民办 |
| 长春中医药大学 | 4122010199 | 吉林省 | 长春市 | 本科 | |
| 黑龙江中医药大学 | 4123010228 | 黑龙江省 | 哈尔滨市 | 本科 | |
| 上海中医药大学 | 4131010268 | 上海市 | 上海市 | 本科 | |
| 南京中医药大学 | 4132010315 | 江苏省 | 南京市 | 本科 | |
| 南京中医药大学翰林学院 | 4132013981 | 江苏省教育厅 | 泰州市 | 本科 | 民办 |
| 浙江中医药大学 | 4133010344 | 浙江省 | 杭州市 | 本科 | |
| 浙江中医药大学滨江学院 | 4133013285 | 浙江省教育厅 | 杭州市 | 本科 | 民办 |
| 安徽中医药大学 | 4134010369 | 安徽省 | 合肥市 | 本科 | |
| 安徽中医药高等专科学校 | 4134012924 | 安徽省 | 芜湖市 | 专科 | |
| 福建中医药大学 | 4135010393 | 福建省 | 福州市 | 本科 | |
| 江西中医药大学 | 4136010412 | 江西省 | 南昌市 | 本科 | |
| 江西中医药大学科技学院 | 4136013437 | 江西省教育厅 | 南昌市 | 本科 | 民办 |
| 江西中医药高等专科学校 | 4136013775 | 江西省 | 抚州市 | 专科 | |
| 山东中医药大学 | 4137010441 | 山东省 | 济南市 | 本科 | |
| 山东中医药高等专科学校 | 4137013778 | 山东省 | 烟台市 | 专科 | |
| 河南中医药大学 | 4141010471 | 河南省 | 郑州市 | 本科 | |
| 湖北中医药大学 | 4142010507 | 湖北省 | 武汉市 | 本科 | |
| 湖北中医药高等专科学校 | 4142012951 | 湖北省 | 荆州市 | 专科 | |
| 湖南中医药大学 | 4143010541 | 湖南省 | 长沙市 | 本科 | |
| 湖南中医药大学湘杏学院 | 4143012661 | 湖南省教育厅 | 长沙市 | 本科 | 民办 |
| 湖南中医药高等专科学校 | 4143013802 | 湖南省 | 株洲市 | 专科 | |
| 广州中医药大学 | 4144010572 | 广东省 | 广州市 | 本科 | |
| 广东江门中医药职业学院 | 4144014610 | 广东省 | 江门市 | 专科 | |
| 广西中医药大学 | 4145010600 | 广西壮族自治区 | 南宁市 | 本科 | |
| 广西中医药大学赛恩斯新医药学院 | 4145013643 | 广西自治区教育厅 | 南宁市 | 本科 | 民办 |
| 成都中医药大学 | 4151010633 | 四川省 | 成都市 | 本科 | |
| 四川中医药高等专科学校 | 4151014010 | 四川省 | 绵阳市 | 专科 | |
| 贵州中医药大学 | 4152010662 | 贵州省 | 贵阳市 | 本科 | |
| 贵阳中医学院时珍学院 | 4152013647 | 贵州省教育厅 | 贵阳市 | 本科 | 民办 |
| 云南中医药大学 | 4153010680 | 云南省 | 昆明市 | 本科 | |
| 保山中医药高等专科学校 | 4153014014 | 云南省 | 保山市 | 专科 | |
| 陕西中医药大学 | 4161010716 | 陕西省 | 咸阳市 | 本科 | |
| 甘肃中医药大学 | 4162010735 | 甘肃省 | 兰州市 |
本科 |
