1368年正月初四，乞丐和尚出身的朱元璋正式称帝，建国号大明，年号洪武，都城设在应天府也就是现在的南京。此时的明朝疆域远没有当初那么大，而且众多的明朝著名将帅当时并未参加开国大典——因为他们在南征北讨。此时湖广行省平章杨璟正在攻打湖南永州，征南将军汤和刚打下福建福州，参政傅友德在打山东莱州、登州，而征虏大将军徐达率领的北伐主力正集结于益都、济南，谋划着下一步的行动。那么这个时候，明朝是没有两京制的，只有一个京师——应天府。
此时，新生的明朝区划有五个行省：
江南等处行中书省，设立于龙凤二年也就是1356年七月初一，在洪武元年八月初一这天裁撤。
江西等处行中书省，设立于龙凤八年也就是1362年正月二十五，是挖了陈友谅的墙脚之后设立的。
湖广等处行中书省，设立于龙凤十年也就是1364年二月二十一，是灭陈汉之后设立的。
江淮等处行中书省，设立于龙凤十年也就是1364年七月，省治庐州府。此行省情况不明，相关研究较少。
浙江等处行中书省，设立于龙凤十二年也就是1366年腊月十二，这个行省是把浙东等处行中书省改名设立的。浙东行省的前身，是龙凤四年腊月十二在婺州设立的中书分省——这个分省也叫浙东分省、宁越分省（朱元璋改婺州路为宁越府），龙凤八年二月二十二日又改中书分省为浙东等处行中书省。
一、南征与北伐：从五省到十一省
同年三月底，徐达率部至开封城北的陈桥驿，早已投降元军的徐宋（徐寿辉）红巾军将领左君弼迎降，明军光复汴梁，旋即沿黄河往西攻取郑州、洛阳。而朱元璋在不久之后由京师应天府亲自前往汴梁，于五月二十一日抵达，并改汴梁路为开封府，还设置了中书分省于开封，一直待到七月二十八，才动身返回应天。
一个多月后的八月初一（这年有个闰七月），朱元璋正式下诏，以金陵为南京，以大梁为北京，正式设立南北二京，注意，此时明朝的北京是开封而并非后来的顺天。为什么朱元璋会选择将开封定为北京，朱元璋给的理由是“朕观中原土壤，四方朝贡道里适均，父老之言乃合朕志，然立国之规模固重，而兴王之根本不轻，其以金陵为南京，大梁为北京，朕于春秋往来巡守，播告尔民，使知朕意”，大致意思就说是开封算是天下正中，南来北往的距离差不多，他把应天和开封设为南北二京，然后仿照元朝的两都巡幸制，跟候鸟一样来回溜达。
注意，此时明朝在各地设置的区划是行中书省——府——州县的体系，后来的南直隶范围在此时仍是属于江南行省+江淮行省，在宣布设立两京的同一天才废弃了江南行省，所属府县直隶于中书省——跟元朝一样。但此时，在河南设立的区划却不叫河南行省，而是叫中书分省——这有别于行中书省，你可以看做是中书省在河南的派出机构。
麻烦就麻烦在江淮行省这个。江淮行省废于何时，并不能确定准确时间，但是在洪武三年五月初一定的科举录取名额中，并没有江淮行省，可见此时江淮已废；至正二十六年四月元朝枢密院同知陆聚归附朱元璋，授江淮行省参政，镇徐州，洪武元年从定山东，改山东行省参政。山东等处行中书省开设于洪武元年四月二十三，是徐达攻占益都之后设立的。可见江淮行省应该就是废于洪武元年四月到洪武三年之间，这期间江淮一带已知的最大的行政调整，就是元年八月初一废江南行省直隶中书省，所以，在没有进一步的资料证明之前，我个人倾向于江淮行省废于洪武元年八月初一，即江淮、江南二行省合并直隶于中书省，江淮行省官改任山东行省。
八月初二，徐达率部从通州攻陷元大都，元顺帝夜出健德门奔上都，徐达随即遣派将领分别占领古北、居庸等关，不久又率部南下攻取了保定、真定、顺德等河北西路之地。至此，燕山以南的河北大地归属明朝。十月二十三，明朝政府对新征服的河北之地进行了区划划分，将怀庆、卫辉、彰德、广平、顺德、大名、河间、保定、真定九府隶河南分省，北平府隶山东行省。
在攻取大都的同时，大将军徐达便开始谋划对山西的军事行动，坐镇北平居中指挥，令傅友德等在南下攻取真、保，再往西攻井陉关，又令右副将军冯宗异、偏将军汤和自河南府（洛阳）渡河北上，由怀庆攻碗子城，两路大军一东一南夹攻山西。十一月，徐达安定好北平军政之后亲率大军赶往井陉，主持对山西的攻略，腊月初一，徐达攻占太原，又开始向太原以北的忻州、崞州、管州、岢岚进行征讨，而冯宗异则在南线攻取了潞、泽、平阳，康茂才则在潼关一带渡河北上攻取河中府、解州。至本年年底，明军基本占领了内长城以南的整个山西。
洪武二年正月二十五，常遇春攻占大同，雁北地区为明朝占据。随即大军南下河中府，谋取入陕。三月初一，明军在河中府强渡黄河，攻入陕西，正月初六攻占奉元路（今西安市），于是常遇春、冯宗异随即整兵向西攻取凤翔。
三月十九，明朝从湖广行省南部析置广西行省，中书分省及山东行省析置北平行省。四月初四，从江西行省南部析置广东行省，又置山西行省、陕西行省，同时又将中书分省（河南分省）改设为河南行省，至此，明朝区划已经扩展到十一个行政区，即一中书省十行中书省。
二、两开花：南方的调整与北方的进取
洪武二年的夏天，明军在陕西的攻势极速展开。四月初四建省，四月初六秦州降，四月十一巩昌降，四月十三临洮降、兰州克，四月十五克安定（定西），四月十九下会州，四月二十一下静宁、开成，右丞薛显帅偏师攻西安州追击元豫王，一直追杀到鸣沙州（宁夏中宁东北），五月初四下平凉、延安，五月初八庆阳降，五月初九下礼店（属宣政院所辖藏区）、泾州，二十七绥德、葭州降，六月初二宁州降，十二原州降，月底环州降。至此，除了复叛的张良臣还盘踞在庆阳，以及秦岭以南的兴元，明军已经攻取了整个陕西。
洪武二年五月十九，明朝第十一行省设立——从浙江行省中析置福、汀、漳、泉、建宁、邵武、兴化、延平八府，置福建行省。
在明军横扫陕西的时候，四月初二，常遇春奉命由陕西调回北平，主持对燕北的攻势。原来，当北伐大军由北平移入山西，继而渡河入陕之后，盘踞上都塞上的北元兵马开始袭扰北平，丞相也速甚至于已经率骑兵攻至通州，于是朱元璋紧急派人从陕西调常遇春回北平，让李文忠给他打下手，率步卒八万、骑兵一万，“取迤北余寇”，出塞扫北。一路连克惠州、锦州、川州、全宁、兴州，击败江文清、也速、脱火赤，直取上都，元顺帝又一次成功逃脱，奔走应昌。六月初七，常遇春、李文忠攻占元上都，随即向北追杀百余里，蓟北悉平。班师回朝的路上，七月初七，师次柳河川，征虏副将军中书平章鄂国公常遇春暴卒军中，年四十。
六月二十六，岭南的广东广西两行省之间发生了重大行政变更——海北海南州府由广西改隶广东。海北海南，是元朝所置二十二道肃政廉访司之一，设于至元三十年，司置雷州，隶江南行台。洪武元年大军南征的时候归附，设钦、廉、高、化、雷、琼六府，下辖儋、万、崖三州，茂名、合浦等二十六县。三月十九，明朝从湖广行省南部析置广西行省，这六府划属广西。其实这也是依着旧制，之前的宋朝，它们隶属于广南西路，元朝时隶属于湖广行省，元末析置广西行省时也是划归广西，此时仍是如此。而六月的这次改变，在广西历史上是很重要的事，至此广西由沿海省份变为内陆省份，而海南、钦廉隶属广东的历史，一直到解放後。
洪武二年秋，在平定了张良臣的叛乱之后，徐达将陕西军务委给冯宗异等将，自己则返回南京参加常遇春的葬礼，实际上此时陕西明军在后勤上也出现了问题——“粮饷不给”。于是，明军的攻势暂时告一段落，征南诸将次第返京，镇守陕西的冯宗异也率部返回南京，南京论功行赏，皆大欢喜，准备热热闹闹过个年。
但很明显天不遂人愿，似乎北元并不想就这么让明军过年。在明军主力班师回朝之后，腊月十九，王保保趁着陕西空虚，自甘肃渡河袭攻兰州，围点打援，阵斩自巩昌来援的鹰扬卫指挥于光。
洪武三年正月初三，朱元璋以徐达、李文忠、冯胜、邓愈、汤和分别担任征虏大将军、左副将军、右副将军、左副副将军、右副副将军，往征沙漠。当时北逃的元顺帝及元廷主力在应昌，王保保在甘肃，于是明军兵分两路，徐达出潼关打王保保，李文忠出居庸关打元顺帝。
西线战事，王保保在定西转战三个月，一无所获，于三月底终于盼来了徐达。四月初八，定西沈儿峪一战，王保保全军覆没，仅被俘将士就有八万四千余，王保保仅以身免，逃往漠北，明军趁机攻取宁夏。陕西安定之后，大将军徐达让左副将军邓愈招谕吐蕃，自己率部过秦岭攻取了元军在陕西最后一个据点——汉中。至此，除了阶、文等州属于割据四川的整个陕西彻底被明军拿下。
在东线，李文忠于二月底率部出居庸关，次第攻占龙庆、怀来等地区，继而在五月上旬再一次攻占元上都，随即北上应昌追杀元顺帝，而元顺帝在十多天前已经去世，其子爱猷识理达腊即位，即北元昭宗。李文忠一个晚上就攻占了应昌，元昭宗带十余名亲信逃走，李文忠派人一直追到临潢。与此同时，山西大同的明军也攻取了蔚州、顺宁（宣府）、东胜、丰州、集宁一带，至此，盘踞应昌、上都的元军主力被击溃。
此时的明朝在北方的疆域拓展到了河套、应昌一线以北，在西南也有拓展，正月二十二，黔东南地区各家土司归附，隶湖广行省。这年年底，朱元璋下令编纂的《大明志书》成书，统计此时的天下有12行省、120府、108州、887县、3安抚司、3长官司，东至海，南至琼崖，西至临洮，北至北平。
三、西陲：四川行省的设立与西番的招抚
洪武三年是明朝最重要的年份，甚至可以说没有之一。
对内，这一年各种朝廷制度出台，明朝实现正规化；对外，两路北伐成功把北方边界推到了漠南，基本解决了宋朝燕云不守的局势。随着北边局势基本稳定，明朝开始把目光转向辽东、四川以及西番各地。洪武三年七月底，明军与割据四川的大夏政权发生了第一次武装冲突。夏政权太尉陈友仁“北伐”攻击了明军驻守的汉中。
洪武四年的新年刚过，明朝就开始谋划对四川的行动。正月初四，宋国公冯胜往陕西修城池，卫国公邓愈往襄阳训练军马，又运粮饷给征蜀军士。
闰三月，征蜀战役开始，平章杨璟自荆州溯三峡而上，对夏军驻守的夔州进行了试探性攻击，结果被击退；四月初，颍川侯傅友德自陕西秦州攻占了夏军驻守的阶州，而三峡一带的明军也开始重新发动对夔州的攻击。对大夏政权的征讨仅仅用时五个月，傅友德率领的北路军横扫西川，而廖永忠、汤和所率东路军也逼近大夏政权的都城重庆，夏帝明昇投降，大夏的七路府、八元帅府、二十五宣慰宣抚司、三十七州、六十七县全部归附明朝。次日，也就是七月二十六，明朝开设四川等处行中书省。至年底，先前归附大夏的湘西、川东南、贵州的各处土司也纷纷上表归附明朝。
而随着洪武三年北伐的胜利，北元在此之后逐渐分崩离析，明朝也趁机开始对北元的地方势力进行招抚。四月，左副副将军邓愈招抚吐蕃，六月，朱元璋遣使诏谕元宗室部落臣民，又遣使持诏谕云南、八番、西域、西洋、琐里、爪哇、畏吾儿等国，九月遣使招抚辽东，十月遣使致书北元昭宗。于是各处宗王、大臣率部归附明朝者络绎不绝。洪武三年六月底，元吐蕃宣慰使何锁南普、镇西武靖王卜纳剌等归降，吐蕃、铁州、洮、岷等地归附明朝。八月初十，元高昌王和尚、岐王桑哥朵儿只班等西番、甘肃诸部归降明朝，不久开设高昌卫、岐山卫、武靖卫。九月初四，宗王扎木赤、指挥把都、百户赛因不花归降，后设官山卫。腊月初五，宗王也先帖木归降；初八，元顺帝皇子失笃儿、国舅阿里麻思海牙、驸马忙哥剌失等归降；初十，左丞哈里沙，平章汪祥庆奴，左丞汪桑哥、赵敏安答儿归降；十九，太尉沙不丁归降。四年正月，西番岷州十八簇归附；枢密都连帖木儿归降，设失宝赤等五千户所。闰三月，宣慰司佥事范自野归降。
西北的招抚问题从洪武三年开始，一直到洪武二十六年才逐渐稳定下来。在明朝经略西北过程中，其中的核心是围绕着两个中心，一个是西安的西安都卫——陕西都司，一个是西安行都卫——陕西行都司。
洪武四年十月初六，明朝置朵甘卫指挥使司，十一月二十一日，置礼店千户所，二十八日置必里千户所。这一系列机构的设置，标志着明朝开始着手对朵甘藏区进行招抚。
这里得说一下元朝治藏历史，关于元朝征服藏区的含金量啥的咱们按下不表，单说元朝对藏区行政区划的设置。
元代的藏区，往往地图上标注为“宣政院辖地”，实际上此地的行政区划是由吐蕃等处宣慰司都元帅府、乌思藏纳里速古鲁等三路宜慰使司都元帅府、吐蕃等路宣慰司都元帅府组成，也就是宣政院辖吐蕃三道。
吐蕃等处包括了河州路、脱思麻路、雅州、黎州、洮州、贵德州、茂州、岷州、铁州、碉门鱼通黎雅长河西宁远等处宣抚司、礼店文州蒙古汉儿军民元帅府等，吐蕃等路包括了朵甘思、剌马尔刚、奔不儿亦思、亦思马儿、天全、六番、长河西、鱼通、宁远等，看上去非常乱，二者在黎、雅、鱼通、宁远一带甚至还有重叠。而吐蕃等处在《元史》上又开列于陕西行省之下，这使得这一地区的管理非常混乱，乱到地图上都没法准备表示。不过我倒是见明镇布武做过一个这种的，大家可以学习一下：
明代设立的礼店千户所就是元代礼店文州蒙古汉儿军民元帅府，必里千户所是元代必里万户府，二者皆隶属于吐蕃等处宣慰司都元帅府。明代设置礼店千户所直属于西安都卫，必里千户所属西安都卫治下的河州卫，可能朵甘卫也是延此旧制，甚至于不久之后设立的乌思藏卫也是如此，那么这意味着明初对于西番的招抚是放在陕西行省治下，也就是说，陕西行省带管了整个藏区。
腊月十七，明朝在西南的黔中腹地又有大动作：置永宁、贵州二卫。这俩卫都是在当地土司里头强行设立的，永宁卫设于四川行省永宁路，也就是永宁土司，贵州卫设于湖广行省贵州宣慰司（顺元八番宣慰司）当时曹国公李文忠镇抚四川，开设了此二卫，但是因为这二卫如果从湖广武昌过去那基本是陆路和逆流水路，而如果从成都过去却是顺流而下转陆路，所以出于交通的考虑，李文忠奏请将贵州卫隶属成都都卫，于是明初的四川行省超越了元代四川行省的规模，开始了四十年的带管黔中的历史。
这年，江西、浙江两个行省发生了一个行政区的变更——广信府由浙江行省改属江西行省。此事在《明史·地理志》上无载，故《中国行政区划通史》的元代卷和明代卷皆未提及此事，甚至于嘉靖《广信府志》也语焉不详，然而嘉靖《永丰县志》卷一沿革表中写了这次变更的原因：“初隶浙江行省，?（以）漕运不便，从行省郎中余德让请，改隶江西布政司。”江西布政司是洪武九年废行省设三司的时候才设的，此处应是改属当时的江西行省。随着广信府由浙江改属江西，明朝福东南地区的行省（布政司）界线基本确定。
四、北疆：重点进攻与重点防御
洪武四年二月二十八，辽阳行省平章刘益以辽东州郡地图，并藉其兵马钱粮之数，遣右丞董遵、佥院杨贤奉表来降，这意味着明军有和平解放辽东的前景，于是明朝拟在得利嬴城设辽东卫，并给刘益空降了一个辽东卫指挥同知的官衔。但好景不长，五月，刘益被北元平章洪保保所杀，这标志着辽东内部的混乱——辽东在“附明”和“附元”之间徘徊，毕竟在明军没有打通的辽西的情况下，辽东距明朝还有个渤海海峡，而距盘踞沈阳的纳哈出却只有两天的路程，但明军凌厉的攻势又让辽东感觉到恐惧。所以当辽东附明派反击干掉了附元派之后，六月二十一，北元右丞张良佐、左丞房暠遣使再入南京，报告了刘益被杀的事，并把参与此事的几名头目械送给明朝。
七月初一，明朝设定辽都卫于辽阳，马云、叶旺为都指挥使，明朝对辽东的经略由此开始。
明朝在辽东的设置，北界在辽阳、沈阳之间，基本就是辽阳府、附郭辽阳县，以及金复海盖四州。这些府州县是隶属于山东行省的，所以这也是为什么谭其骧在地图集里，会把辽东都司标成山东的原因，这是历史遗留的因素。
洪武四年三月，也就是明朝准备介入入驻辽东的同时，明军在正面的北平行省采取了战略性撤退，上一次是明军继洪武二年常遇春攻占元上都之后的撤退。实际上，洪武二年常遇春那次只是一次军事行动，并未有开拓疆土的打算。洪武三年北伐的胜利，北元王廷远遁沙漠，明朝实际占领了元朝上都、兴和、大同等地的广大领土。但因为十多年前红巾军和元军在此处的拉锯，此处本就不多的人口更显稀薄，而明军又不可能在这千里新附草原上处处设防——那会处处挨打的，于是洪武四年三月二十一，徐达令都指挥使潘敬等人，将顺宁府、宜兴州一带的沿边之民17274户、93874口迁入北平。
六月二十七日，徐达再次徙“北平山后之民”。这次迁徙的有35800户、197027口。
这两次的内徙几乎是把山后的上都、兴和、松州等处人口扫荡一空全部搬走——如果你对这个数字没有什么概念，那可以做个对比：洪武二年整个北平府也才不过两万户。
“山后”这个词是明史的冷门，却是个很值得研究的话题，它牵涉到明朝的户籍制度、军事制度、战略方向等等多个问题。而由此产生的“山后籍”，起码能写出一个博论来。大致而言就是，明初从未放弃过对阴山-燕山以北的漠南草原的想法，但受限于局势，只好暂时收缩，将此地的军民全部内迁到长城一线以南，但因为户籍这玩意在明朝牵涉甚众，比如科举的名额，比如军籍的管理，这些放弃的地方的民户、军户在登记造册的时候，无法按居住地来填写，所以只好创造性地设置了“山后籍”，代表这人/户是洪武初年从开平、东胜、大宁、集宁等地迁过来的，将来开疆拓土光复了这一地区之后，这些人就可以回家了。
大抵而言，洪武四年开始，明朝在北边四行省（从东往西依次为山东、北平、山西、陕西）采取的策略是不一样的，中间的北平、山西是凭城固守，采取守势，集中力量，所以开平、兴和、顺宁的人口大量迁入北平府，以北平府为中心，而北平在城的卫所也是明朝最多的，山西则以晋北的大同为中心。而两翼的山东、陕西则积极开展招抚、扩展行动，山东行省渡海进入辽东，陕西开展对藏区、陇南的招抚，这一趋势在洪武五年三路扫北的行动失败后更加明显，延续了将近十年。
洪武四年腊月初六，中书省对于大明的家底合计一下，此时的大明有141府、192州、1013县，相对于洪武三年的120府、108州、887县，增加了近五分之一。
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